88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1263 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1263  transposase subunit; putative  100 
 
 		 54 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1337  integrase, catalytic region  92.31 
 
 		 39 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  68.29 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  68.29 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  81.82 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  81.82 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  81.82 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  81.82 
 
 		 304 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  81.82 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  81.82 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  75.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  75.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  75.76 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  75.76 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  75.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  75.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  75.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  78.79 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0119  transposase subunit; putative  75.76 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0827163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  72.73 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  69.7 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  69.7 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  69.7 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  69.7 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  72.73 
 
 		 295 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  72.73 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  72.73 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  69.7 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  69.7 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 301 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  63.64 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  63.64 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  69.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3011  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.747971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  69.7 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  66.67 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  66.67 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  66.67 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  64.52 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  66.67 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  63.64 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  66.67 
 
 		 295 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 166 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 308 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 311 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>