More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5582 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  49.65 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  55.42 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  55.42 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  47.75 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  55.46 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  55.46 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  55.46 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  55.46 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  55.46 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  51.58 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  51.58 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  51.58 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  51.58 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  46.33 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  46.33 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  46.33 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  47.18 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  51.03 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  48.79 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  50.34 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  50.34 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  45.36 
 
 		 288 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  50 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  53.47 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  52.52 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  52.67 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  52.52 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  46.58 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  52.5 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  52.5 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  52.52 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  49.79 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  49.79 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  46.92 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  52.52 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  52.5 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  45.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  45.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  45.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  45.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  45.64 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  46.42 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  46.42 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  45.17 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  49.36 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  51.67 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  40.74 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  52.42 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  52.42 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  51.98 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  51.98 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  42.81 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  42.81 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  42.81 
 
 		 375 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  50.42 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>