93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1122 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1122  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 402 aa  765    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3230  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 756 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.75 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.75 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.75 
 
 		 547 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.75 
 
 		 547 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  32.75 
 
 		 592 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.75 
 
 		 625 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 455 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 715 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 715 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 747 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  23.6 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  26.52 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 689 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  30.3 
 
 		 683 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.05 
 
 		 764 aa  76.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.82 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  27.21 
 
 		 715 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.25 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  22.6 
 
 		 816 aa  67  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 749 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.14 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  23.59 
 
 		 703 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.14 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.48 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  21.88 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  21.88 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  25.24 
 
 		 883 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 750 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.41 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.41 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  28.77 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  25.17 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  25.65 
 
 		 951 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  21.79 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  24.18 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.67 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  23.25 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.74 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  22.26 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  20.73 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  21.13 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 767 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  20.78 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.59 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  25.5 
 
 		 806 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.59 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  21.25 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>