More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3172 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1091  hypothetical protein  86.09 
 
 		 171 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  68 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  55.41 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  44.83 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  32.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  32.39 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.65 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.65 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.25 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.25 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  34.03 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.37 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  53.85 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  30.94 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.85 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  33.09 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  31.69 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  30.28 
 
 		 209 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.82 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.72 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  31.39 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  31.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.06 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  51.39 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.08 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.88 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.89 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  29.5 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  30.22 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  34.95 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  34.95 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  47.22 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  52.73 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  28.37 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  35.43 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  51.56 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35.64 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  28.26 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.21 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.13 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  46.75 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  29.5 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  29.5 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  61.7 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  58 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  28.38 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  26.39 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  30.84 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  63.83 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44.59 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  33.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  45.83 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  48.39 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  70.27 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.42 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  26.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26.28 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  55.77 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  26.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  31.2 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  28.28 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  26.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  26.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  72.22 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>