157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3342 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  902    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0031  hypothetical protein  82.59 
 
 		 442 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  67.48 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0254  hypothetical protein  62.08 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0238  hypothetical protein  61.86 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.782841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1719  hypothetical protein  59.39 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  32.8 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  32.3 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  32.48 
 
 		 369 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  32.73 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  31.4 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  31.67 
 
 		 367 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  31.82 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  31.82 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  29.55 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  29.27 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  30.08 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  29.52 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  28.68 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  30.42 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  27.97 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  27.01 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  30.22 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  27.03 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  27.54 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  24.92 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  25.19 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  25.19 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  26.58 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  26.22 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  25.09 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  31.41 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  24.6 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  24.6 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  33.88 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  24.26 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  33.06 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  33.06 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  35.85 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  31.54 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  31.54 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  25.73 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  28.29 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  24.73 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  24.38 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  33.61 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  29.94 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  30.26 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  26.97 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  31.97 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  26.76 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  30 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  28.81 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  30.58 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  27.43 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  30.3 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  34.91 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  27.67 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  33.02 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  27.67 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  32.08 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  32.08 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  27.67 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  30.4 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  30.4 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  28.99 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  29.6 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  29.71 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>