156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4309 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  924    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  67.48 
 
 		 447 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0031  hypothetical protein  73.67 
 
 		 442 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0238  hypothetical protein  63.52 
 
 		 453 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.782841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0254  hypothetical protein  63.74 
 
 		 453 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1719  hypothetical protein  60.3 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  34.56 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  33.04 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  32.65 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  31.38 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  31.44 
 
 		 368 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  32.37 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  30.83 
 
 		 368 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  30.83 
 
 		 368 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  29.79 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  28.62 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  30.25 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  28.98 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  27.97 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  28.74 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  27.76 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  29.49 
 
 		 368 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  27.61 
 
 		 398 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  30.7 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  26.3 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  27.68 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  37.9 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  25.09 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  25.09 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  31.45 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  31.11 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  25.09 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  28.22 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  29.32 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  31.58 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  31.58 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  29.14 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  29.32 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  30.21 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  30.21 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  25.81 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  30.19 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  36.07 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  34.71 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  30.92 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  38.68 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  34.43 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  32.8 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  32.8 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  25.47 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  32.8 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  32.8 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  24.72 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  24.72 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  30.19 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  29.61 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  33.88 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  24.72 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  34.06 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  25.47 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  31.29 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  29.49 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  27.07 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  29.49 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  27.07 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  23.93 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  32.37 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  23.86 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  27.39 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  27.11 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  30 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  25.82 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  27.37 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  27.03 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  25.45 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>