158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1719 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1719  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  946    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  59.91 
 
 
447 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0238  hypothetical protein  65.88 
 
 
453 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.782841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0254  hypothetical protein  65.45 
 
 
453 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  61.82 
 
 
455 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0031  hypothetical protein  60.92 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305172  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  33.21 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  33.95 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  32.33 
 
 
369 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  30.62 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  32.07 
 
 
368 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  31.56 
 
 
368 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  31.62 
 
 
368 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  31.62 
 
 
368 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  30.97 
 
 
382 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  30.49 
 
 
368 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  28.19 
 
 
422 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  30.92 
 
 
384 aa  97.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  29.12 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  30 
 
 
376 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  32.04 
 
 
368 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  28.83 
 
 
394 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  38.69 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  27.95 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  31.58 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  29.32 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  36.5 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  30.37 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  38.52 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  36.5 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  26.92 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  38.52 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  38.52 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  35.04 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  26.92 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  29.84 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  37.7 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  35.04 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  29.84 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  29.32 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  35.77 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  26.82 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  29.91 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  32.47 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  35.04 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  29.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  25.66 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  34.31 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  33.12 
 
 
423 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  28.73 
 
 
385 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  35.77 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  35.04 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  29.53 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  32.73 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  26.45 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  29.91 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  35.77 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  32.11 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  29.53 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  29.53 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  33.58 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  35.04 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  34.31 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  34.31 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  39.32 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  39.32 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  39.25 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  28.5 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  36.03 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  28.5 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  34.67 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  27.63 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  37.31 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  37.31 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  26.01 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  31.17 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  36.57 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  36.57 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  36.57 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  36.57 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>