101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7191 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  60.32 
 
 
324 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  61.66 
 
 
321 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  63.02 
 
 
325 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  60.32 
 
 
314 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  58.92 
 
 
325 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  59.03 
 
 
327 aa  358  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  57.74 
 
 
319 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.1 
 
 
318 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4406  hypothetical protein  68.5 
 
 
159 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.462576  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  33.33 
 
 
266 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 
260 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
261 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
268 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 
258 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.34 
 
 
274 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 
252 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.87 
 
 
263 aa  86.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.97 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.75 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.75 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.32 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.78 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  29.12 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.84 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  26.54 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  35 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  26.61 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
293 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.48 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  25.59 
 
 
254 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  24.9 
 
 
253 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 
253 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.96 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.96 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  25.23 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.23 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.26 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
250 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.57 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.49 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.09 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.35 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.35 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  25.34 
 
 
253 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 
257 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.09 
 
 
250 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.32 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.27 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.85 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
250 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
258 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.07 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.33 
 
 
400 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  43.37 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
259 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.02 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  38.26 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.1 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.5 
 
 
405 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  57.5 
 
 
405 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  57.5 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  52 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.66 
 
 
404 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  35.96 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  55 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  52 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  26.96 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 
146 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 
404 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.5 
 
 
397 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  25.19 
 
 
223 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  55 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>