147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2391 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  50.41 
 
 
254 aa  260  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.19 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.6 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.36 
 
 
249 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  45.52 
 
 
271 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.08 
 
 
257 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  43.51 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41 
 
 
258 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.94 
 
 
259 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.94 
 
 
259 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.94 
 
 
259 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.51 
 
 
259 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  40.76 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  76.83 
 
 
88 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.71 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.87 
 
 
268 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.1 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
261 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  29.46 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
260 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  32.35 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.07 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.64 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.51 
 
 
290 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
259 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
261 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.2 
 
 
281 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 
300 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  28.4 
 
 
253 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.8 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 
272 aa  95.1  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.12 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  27.31 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  31.5 
 
 
283 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  28.74 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.65 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.65 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.65 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  29.91 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.57 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.15 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.03 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.38 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  27.22 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.02 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  26.92 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  26.32 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  24.89 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  24.14 
 
 
325 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 
318 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  26.15 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.61 
 
 
146 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  23.91 
 
 
321 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  27.87 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.55 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  24.89 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1011  cell division ATPase MinD  26.69 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.381941  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.06 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  25.32 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  26.36 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2916  protein of unknown function DUF59  47.27 
 
 
389 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.0263607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.85 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  24.58 
 
 
287 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  24.69 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  23.64 
 
 
368 aa  46.2  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.44 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  45.28 
 
 
380 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 
309 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>