251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0381 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.04 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  55.51 
 
 
268 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 
258 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.23 
 
 
293 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  50.88 
 
 
283 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.98 
 
 
254 aa  165  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  44.39 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.27 
 
 
260 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.53 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.24 
 
 
260 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.23 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.09 
 
 
261 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 
260 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 
260 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 
268 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.17 
 
 
258 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.23 
 
 
252 aa  142  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.71 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.38 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.35 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.93 
 
 
259 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 
265 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
253 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 
263 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.89 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  37.14 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
272 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  34.26 
 
 
284 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  37.5 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  33.97 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 
281 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  38.92 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 
254 aa  92  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  29.95 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 
258 aa  89  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  27.66 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  29.19 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.9 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  30.52 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.11 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  32.41 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.82 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.79 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  27.49 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  37.37 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  30.77 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  30.05 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  32.04 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.56 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  25.9 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  27.18 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.14 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  27.32 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  27.32 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.27 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.27 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  26.96 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.42 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  26.6 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  26.6 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  27.09 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  25.12 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  26.24 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  27.05 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>