77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1355 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
318 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  66.56 
 
 
324 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  69.94 
 
 
321 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  66.56 
 
 
319 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  66.77 
 
 
314 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  63.69 
 
 
327 aa  394  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  61.64 
 
 
325 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  62.42 
 
 
325 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  58.63 
 
 
334 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4406  hypothetical protein  44.07 
 
 
159 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.462576  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
260 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.28 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.14 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.17 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  27.27 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.78 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.36 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.12 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  30.56 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.62 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.2 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  26.55 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.95 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.69 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 
249 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.54 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 
260 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.23 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  25.76 
 
 
262 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
250 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 
250 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.41 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  28.37 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.05 
 
 
250 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.9 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.9 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.64 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  28.44 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.11 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
258 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.4 
 
 
260 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  26.6 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.72 
 
 
260 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.43 
 
 
250 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.32 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  21.96 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.94 
 
 
259 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>