192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1029 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
252 aa  503  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.98 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.32 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.64 
 
 
260 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.66 
 
 
263 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.78 
 
 
268 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  46.46 
 
 
266 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.87 
 
 
253 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.88 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.81 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.23 
 
 
260 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.81 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.81 
 
 
260 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.11 
 
 
260 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.02 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.17 
 
 
249 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.31 
 
 
261 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.07 
 
 
263 aa  185  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.33 
 
 
281 aa  175  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.91 
 
 
272 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.44 
 
 
300 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.23 
 
 
275 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.66 
 
 
259 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.37 
 
 
258 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  38.12 
 
 
284 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  37.13 
 
 
290 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.19 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  39.37 
 
 
213 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  41.06 
 
 
283 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  37.38 
 
 
268 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  37 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.69 
 
 
265 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  34.7 
 
 
223 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.15 
 
 
293 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.76 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.75 
 
 
250 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  34.16 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
250 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
253 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  33.47 
 
 
253 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  32.39 
 
 
262 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.88 
 
 
249 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.25 
 
 
252 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  27.4 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  27.2 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.64 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 
250 aa  92  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  28.12 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  29.66 
 
 
325 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  32.31 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.5 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
258 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.14 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.77 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.77 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.26 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  32.22 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  33.48 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.29 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  32.16 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  27.63 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.6 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.27 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  28.38 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.87 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.96 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.55 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  26.67 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  36.19 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  26.46 
 
 
397 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 
309 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.19 
 
 
404 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0398  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
282 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000000000926955  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0602  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
282 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351329  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  26.46 
 
 
397 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.97 
 
 
353 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  53.33 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  44.93 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.28 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>