170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3029 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  100 
 
 
268 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.46 
 
 
258 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  58.84 
 
 
283 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.78 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.25 
 
 
275 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.48 
 
 
293 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.23 
 
 
254 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 
261 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.71 
 
 
268 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.76 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 
260 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  38.79 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.79 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.67 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 
260 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.11 
 
 
261 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.94 
 
 
274 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 
255 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
253 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.87 
 
 
249 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.32 
 
 
265 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.38 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.81 
 
 
259 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  37.35 
 
 
223 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.82 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  35.94 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
272 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  37.58 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.01 
 
 
290 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 
254 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  32.38 
 
 
290 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  27.31 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  28.71 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  26.52 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  28.92 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.83 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  25.18 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
274 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
250 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.14 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.14 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.14 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.67 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.82 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.77 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.33 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  33.98 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  28.79 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  31.16 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  29.25 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.58 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  26.26 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.92 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  26.89 
 
 
325 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  29.27 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  27.86 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.26 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.25 
 
 
146 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  45.16 
 
 
384 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  41.82 
 
 
385 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  58.7 
 
 
621 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  45 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  24.49 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  44.26 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  22.38 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  52.17 
 
 
729 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25.49 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25.49 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  22.22 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  22.38 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  48 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  52.17 
 
 
587 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>