83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4886 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  100 
 
 		 327 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  67.09 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  61.37 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  61.64 
 
 		 319 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.69 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  62.42 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  61.11 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  57.19 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  59.28 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4406  hypothetical protein  42.61 
 
 		 159 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.462576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.03 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.78 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.51 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.84 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.26 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.91 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  31.03 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.14 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.87 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.2 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.58 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.18 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.88 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  27.8 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.43 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.29 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  26.15 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.23 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  26.46 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.97 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.82 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  27.8 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 250 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.83 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.12 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.65 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.65 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.17 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.19 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  22.9 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.53 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.35 
 
 		 398 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  37.35 
 
 		 397 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.06 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  38.55 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  28.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.31 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.29 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.29 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.59 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  36.59 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.29 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  44.68 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>