228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0933 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.18 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  56.32 
 
 
283 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  60.23 
 
 
268 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 
275 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.46 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.68 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.38 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  41.9 
 
 
266 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 
260 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.91 
 
 
260 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
260 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
268 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 
260 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.95 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
263 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.01 
 
 
260 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.49 
 
 
263 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 
258 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.39 
 
 
265 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.37 
 
 
252 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.51 
 
 
255 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
259 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.12 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.32 
 
 
272 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  37.86 
 
 
284 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  42.04 
 
 
223 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  36.97 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  36.79 
 
 
213 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  37.02 
 
 
290 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.32 
 
 
251 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.82 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  33.33 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 
258 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.9 
 
 
254 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
250 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  33.16 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.41 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.68 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  29.21 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
259 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
259 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 
259 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  31.82 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.68 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.68 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.12 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.02 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.34 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  41.11 
 
 
212 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  30.23 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  36.27 
 
 
319 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  27.13 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.66 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  28.4 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  30.62 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  32.21 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  30.29 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.67 
 
 
314 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.82 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 
146 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  29.29 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  29.23 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  30.65 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25.74 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25.74 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  31.79 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  27.98 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D24  ATPase for chromosome partitioning  24.58 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0126425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  29.02 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  29.74 
 
 
265 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  29.74 
 
 
265 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  29.74 
 
 
265 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  29.74 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>