152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1780 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.78 
 
 
258 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  82.95 
 
 
258 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  79.25 
 
 
212 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.56 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.54 
 
 
259 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.84 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  40.93 
 
 
254 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  37.94 
 
 
262 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.33 
 
 
254 aa  175  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
257 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  36.86 
 
 
271 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
261 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
260 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.32 
 
 
263 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.59 
 
 
268 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.8 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.88 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
260 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
263 aa  92  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
258 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.84 
 
 
272 aa  85.1  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  28.44 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  26.24 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.52 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.86 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  31.06 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  26.56 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.02 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  26.56 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  29.53 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  29.53 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.21 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.83 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.29 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  24.42 
 
 
325 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  25.46 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  23.85 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  25.66 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.41 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  24.54 
 
 
319 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  27.12 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  25.86 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  24.53 
 
 
324 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  25.34 
 
 
287 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.36 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  21.68 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  26.12 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.36 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  24.78 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  24.76 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  22.64 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.01 
 
 
146 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1911  cell division ATPase MinD  25.33 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  25.21 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  24.6 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  22.37 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  25.31 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  24.8 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  24.88 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.33 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.11 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.32 
 
 
260 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.32 
 
 
260 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  26.52 
 
 
270 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  36.84 
 
 
88 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  24.89 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  24.5 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  23.9 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  24.9 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>