192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0874 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.22 
 
 
252 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 
250 aa  278  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.35 
 
 
251 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  43.39 
 
 
260 aa  224  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  43.39 
 
 
260 aa  224  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.9 
 
 
250 aa  223  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  42.98 
 
 
260 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  42.15 
 
 
260 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.6 
 
 
250 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.04 
 
 
252 aa  218  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.2 
 
 
250 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.2 
 
 
250 aa  214  9e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.08 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.15 
 
 
274 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  41.53 
 
 
253 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.74 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  40.96 
 
 
253 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.87 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.74 
 
 
253 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.17 
 
 
250 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.06 
 
 
260 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.46 
 
 
265 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.55 
 
 
146 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
260 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 
260 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  30.35 
 
 
259 aa  115  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.46 
 
 
261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.27 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
258 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.02 
 
 
274 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 
263 aa  105  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
260 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.03 
 
 
254 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 
261 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
263 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  33.09 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  25.7 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.91 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  33.2 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  33.18 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.04 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.55 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  33.06 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  24.38 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  25.68 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.98 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  34.36 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  34.63 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.98 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  34.56 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  34.63 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  31.05 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.31 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.8 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.41 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  24.07 
 
 
258 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.69 
 
 
293 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  29.92 
 
 
319 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.41 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.41 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.41 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  27.67 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  28.5 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  30.08 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  27.06 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.1 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  28.88 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  25.49 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.92 
 
 
387 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  26.36 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  26.19 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  26.46 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.97 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  25.4 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  29.49 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  25.19 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.46 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  27.98 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  27.49 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  27.17 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  23.81 
 
 
265 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  28.02 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  28.02 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  28.02 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>