162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2761 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.63 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.95 
 
 
252 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.77 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.77 
 
 
250 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.81 
 
 
253 aa  209  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.37 
 
 
250 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.45 
 
 
251 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
250 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.4 
 
 
258 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.08 
 
 
274 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  39.92 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  39.92 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  39.92 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.56 
 
 
250 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
249 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  36.9 
 
 
260 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.85 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.99 
 
 
258 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  39.29 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  39.75 
 
 
253 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.06 
 
 
146 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
260 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
260 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  31.98 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.05 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  28 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  30.64 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
268 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  33 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.23 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  30.58 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.32 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.19 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  30.77 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.95 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  31.15 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.83 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.15 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  33.67 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  29.19 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  28.82 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  27.5 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  29.41 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.98 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.65 
 
 
321 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  32.28 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  24.89 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  25.5 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  29.25 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.95 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  28 
 
 
325 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.39 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.73 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  23.58 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.51 
 
 
397 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.6 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.28 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.9 
 
 
397 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.29 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  25.11 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  29.84 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  25.37 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  54.76 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.74 
 
 
259 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
259 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  27.03 
 
 
265 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>