221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2777 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
260 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.74 
 
 
265 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.6 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.65 
 
 
250 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 
250 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.25 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 
258 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 
249 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.73 
 
 
250 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  32.13 
 
 
260 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  32.13 
 
 
260 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  32.13 
 
 
260 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.62 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
253 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  31.5 
 
 
253 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
258 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.96 
 
 
260 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  33.19 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.32 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
253 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.34 
 
 
260 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
250 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.16 
 
 
251 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.19 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.64 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.51 
 
 
146 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.67 
 
 
259 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  28.46 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  30.31 
 
 
290 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.16 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  27.8 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.84 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.15 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  31.5 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  30.42 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  27.6 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  29.01 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.86 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.64 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.25 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.61 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  24.72 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  25.48 
 
 
295 aa  58.5  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
301 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.91 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.26 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.2 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  31.52 
 
 
390 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.62 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  25.44 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.13 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  25.19 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.41 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.28 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5392  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.44 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.28494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.66 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  23.47 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  26.51 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0040  ParaA family ATPase  24.74 
 
 
288 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00514136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  26.18 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>