169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1235 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.18 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  58.46 
 
 
283 aa  291  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  58.56 
 
 
268 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.04 
 
 
275 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.74 
 
 
293 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.12 
 
 
254 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  43 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.56 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.12 
 
 
268 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.75 
 
 
260 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.26 
 
 
261 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
274 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.98 
 
 
260 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
260 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.93 
 
 
261 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.17 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.79 
 
 
258 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.3 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.84 
 
 
263 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.41 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.3 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.19 
 
 
252 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.95 
 
 
272 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
251 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  36.89 
 
 
290 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  38.68 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  36.23 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  37.8 
 
 
223 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  37.89 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.25 
 
 
258 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  34.3 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
254 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 
250 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.17 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  33.5 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  31.16 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.5 
 
 
250 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.07 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.66 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  31.16 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.12 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.13 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  33.17 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  33.17 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.38 
 
 
274 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
252 aa  89  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  31.12 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.02 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  32.26 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.35 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
258 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.09 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  29.51 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.22 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  32.35 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  32.84 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  31.4 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.21 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  27.04 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.61 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  31.46 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  29.86 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  28.92 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.7 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25.76 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25.76 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.84 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  39.24 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  30.1 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  25.71 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  26.36 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  29.95 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  27.04 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  27.04 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  53.19 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  27.04 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>