More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0617 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  100 
 
 
290 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  75.09 
 
 
284 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  61.89 
 
 
290 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.99 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.02 
 
 
300 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.38 
 
 
281 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.53 
 
 
263 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 
274 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  44.06 
 
 
266 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.1 
 
 
260 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.92 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41 
 
 
258 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.5 
 
 
261 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.69 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.45 
 
 
260 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.19 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.96 
 
 
260 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
260 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.82 
 
 
268 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.07 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 
263 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
259 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
251 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.68 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.14 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37 
 
 
252 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  33.49 
 
 
268 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  31.34 
 
 
223 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.8 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
250 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  29.51 
 
 
262 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
250 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  33.96 
 
 
283 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 
250 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  30.95 
 
 
213 aa  95.9  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  29.95 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.81 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  27.56 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  26.25 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  26.78 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.4 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.58 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  24.76 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  29 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.52 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.34 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.34 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  29.21 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  27.65 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  29.84 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.65 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  27.57 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  26.83 
 
 
325 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  28.18 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
410 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.44 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.24 
 
 
452 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.29 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.05 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  27.8 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.54 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  55.93 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.24 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.18 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.45 
 
 
470 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.85 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  47.46 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 
392 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  48.44 
 
 
345 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3120  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.71 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136524  normal  0.126924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  40 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 
462 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>