78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0754 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 324 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  73.19 
 
 		 319 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  67.49 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.56 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  64.26 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  61.37 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  62.04 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  62.46 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  60.59 
 
 		 334 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4406  hypothetical protein  45.61 
 
 		 159 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.462576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  33.61 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 		 260 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.7 
 
 		 263 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 268 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.3 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.32 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  29.39 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.13 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.55 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.52 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  30.22 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.96 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  24.89 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  29.55 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.57 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.06 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  26.26 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  27.48 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.39 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.18 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  22.68 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.18 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.32 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.68 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.39 
 
 		 258 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.25 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  23.26 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  26.36 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.22 
 
 		 146 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4522  chromosome partitioning ATPase  45.45 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.7 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>