125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1132 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  70.04 
 
 
283 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  57.4 
 
 
268 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.23 
 
 
275 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.74 
 
 
258 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.46 
 
 
258 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.47 
 
 
254 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.39 
 
 
261 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.31 
 
 
274 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  40 
 
 
266 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.23 
 
 
260 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.23 
 
 
260 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.76 
 
 
260 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.23 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.17 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 
261 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.9 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
265 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.41 
 
 
263 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.4 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.56 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.8 
 
 
253 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.27 
 
 
249 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.15 
 
 
252 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.38 
 
 
263 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  35.63 
 
 
213 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  33.81 
 
 
290 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  37.87 
 
 
223 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  35.02 
 
 
284 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
281 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  30.24 
 
 
290 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.18 
 
 
251 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
258 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.84 
 
 
272 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 
254 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.66 
 
 
258 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  34.65 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  32.08 
 
 
262 aa  99  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  26.74 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
259 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
259 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.18 
 
 
259 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  44.9 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.67 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.19 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  27.08 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  28.64 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.79 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  32.31 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.69 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.1 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.73 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  28.14 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.73 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.73 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  27.78 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  30.59 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.86 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  31.9 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.65 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 
146 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  28.71 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  27.08 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  26.46 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  26.46 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  26.46 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  28.21 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  27.45 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  24.06 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  28.64 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.52 
 
 
265 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  26.15 
 
 
265 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  30 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  27.18 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  27.18 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>