85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2848 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  67.09 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  62.78 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  62.46 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  63.55 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  62.74 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.42 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  58.26 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  63.19 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4406  hypothetical protein  46.51 
 
 		 159 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.462576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.29 
 
 		 266 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 		 268 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.7 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 		 252 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.66 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.81 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  26.73 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  26.83 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  26.92 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  33.33 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.15 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.03 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.25 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.96 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.99 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  27.95 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.88 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.83 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.46 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.46 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.46 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  23.48 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  26.48 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  26.42 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.56 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  25 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.72 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.06 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.94 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  27.86 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  40.96 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  25.68 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  25.68 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.9 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  37.35 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  38.75 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.83 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  27.03 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.35 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  37.35 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.71 
 
 		 146 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0519  hypothetical protein  23.41 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.185936  normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  25.23 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>