142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2510 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  43.95 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.43 
 
 
258 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.92 
 
 
249 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.94 
 
 
254 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  40.82 
 
 
271 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  35.39 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.39 
 
 
258 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.25 
 
 
259 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
259 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
259 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
259 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  34.39 
 
 
212 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 
254 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 
268 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
261 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 
261 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.39 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.13 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.78 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  33.96 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  27.76 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.78 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.41 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.56 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 
253 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  27.97 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  32.12 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.8 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.05 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  28.93 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  30.1 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  30.25 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  39.51 
 
 
88 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.17 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.17 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.69 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.69 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.97 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.69 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.66 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  24.9 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.63 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 
308 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  25.62 
 
 
325 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  51.79 
 
 
387 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  26.82 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  25.19 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.26 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  24.08 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
374 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  27.43 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 
146 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  25.43 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  23.75 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.32 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3828  hypothetical protein  42.86 
 
 
380 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  0.0295113 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  40.3 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  28.26 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.4 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  41.67 
 
 
789 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  28.26 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.89 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  41.79 
 
 
383 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  44.64 
 
 
384 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  50.94 
 
 
381 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>