105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0703 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  100 
 
 
260 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  100 
 
 
260 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  98.46 
 
 
260 aa  521  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  93.08 
 
 
260 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.22 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
250 aa  248  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.94 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.56 
 
 
251 aa  224  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.74 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.63 
 
 
250 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.29 
 
 
258 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.98 
 
 
258 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  43.36 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.63 
 
 
274 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.17 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.56 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.56 
 
 
250 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.96 
 
 
250 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  41.41 
 
 
253 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.27 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
253 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 
250 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.89 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.52 
 
 
146 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  30.31 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.72 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
260 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
260 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  28.65 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.15 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.12 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.14 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
249 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.72 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  27.97 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.21 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  30.57 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  28.57 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.34 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  29.37 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  27.57 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  30 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  26.09 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  31.25 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  29.41 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  21.59 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.14 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.77 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.37 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.82 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  26.54 
 
 
334 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.65 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.18 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  26.94 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.44 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.1 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 
259 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
259 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
259 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  25 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1911  cell division ATPase MinD  24.81 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  25.68 
 
 
325 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  23.85 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.6 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  24.71 
 
 
259 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  26.05 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.46 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.63 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>