217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1681 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  95.77 
 
 
260 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.77 
 
 
260 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.62 
 
 
260 aa  421  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.24 
 
 
263 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.53 
 
 
261 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.49 
 
 
254 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.05 
 
 
258 aa  221  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  42.97 
 
 
266 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.7 
 
 
268 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.79 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.96 
 
 
263 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.23 
 
 
252 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.02 
 
 
255 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.85 
 
 
274 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.26 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.46 
 
 
253 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  46.58 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.16 
 
 
259 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.19 
 
 
260 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.69 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  46.5 
 
 
213 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.28 
 
 
265 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.77 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.27 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  37.85 
 
 
290 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 
281 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  37.07 
 
 
284 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 
258 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  36.45 
 
 
290 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  35.15 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.23 
 
 
275 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.46 
 
 
250 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  34.76 
 
 
268 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.49 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.36 
 
 
250 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.93 
 
 
250 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 
253 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.28 
 
 
293 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.5 
 
 
250 aa  125  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  34.6 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.98 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  33.96 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  34.34 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
251 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
265 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
250 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  32.39 
 
 
254 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.32 
 
 
260 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
252 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
258 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.87 
 
 
249 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.74 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.74 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.37 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  32.42 
 
 
271 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  28.68 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.15 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 
274 aa  95.1  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  31.95 
 
 
212 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  31.06 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  29.55 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  26.56 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  26.48 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  27.92 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  24.21 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.41 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1911  cell division ATPase MinD  25.38 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  25.99 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  24.89 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  25.11 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.1 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  26.92 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 
288 aa  55.5  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  26.97 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  25.19 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.33 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  26.05 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  25.38 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  24.14 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  24.14 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  25.72 
 
 
304 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>