78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1374 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  58.59 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.8 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  29.72 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  29.72 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  29.72 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.38 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  29.73 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  28.68 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.05 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.75 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.29 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.04 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  28.1 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.8 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  27.87 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  27.23 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  28.46 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  30 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.26 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  25.65 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.76 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.76 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.43 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.76 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.19 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.29 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  27.6 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  22.45 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3515  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  30.26 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>