219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0342 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.39 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  40.93 
 
 
258 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.8 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.54 
 
 
259 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.54 
 
 
259 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.54 
 
 
259 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  44.72 
 
 
254 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
257 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  40.51 
 
 
262 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.41 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.08 
 
 
249 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  35.9 
 
 
271 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  37.06 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.8 
 
 
263 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.18 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.67 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
259 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.24 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.9 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.89 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  35.33 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  31.8 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.23 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.94 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.23 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  30.85 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.23 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.43 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  28.71 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  23.64 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.12 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.05 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  23.26 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  23.26 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.14 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.51 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.89 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.12 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  23.26 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  24.8 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  24 
 
 
290 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  24.79 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.64 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  26.83 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  23.69 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  25.94 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 
146 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.48 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  25.52 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  25.62 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  23.77 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  24.48 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  26.36 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  22.89 
 
 
273 aa  52  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  24.65 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.09 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.61 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  28.8 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4628  hypothetical protein  24.41 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000169807  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.61 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  24.34 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  24.35 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  24 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  23.6 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  23.97 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000561907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.37 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  27.65 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  23.6 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  24.34 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  24.72 
 
 
270 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1275  cell division inhibitor MinD  24.34 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000562763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  24.34 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>