110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2232 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  100 
 
 
283 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.04 
 
 
293 aa  330  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.46 
 
 
258 aa  291  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.32 
 
 
258 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  58.12 
 
 
268 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.88 
 
 
275 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
274 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.98 
 
 
260 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.38 
 
 
254 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.09 
 
 
261 aa  148  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.56 
 
 
260 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.15 
 
 
260 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  39.41 
 
 
266 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.69 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.18 
 
 
265 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.67 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.76 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.71 
 
 
260 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.22 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.17 
 
 
255 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.2 
 
 
258 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.98 
 
 
259 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
253 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.06 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  35.83 
 
 
213 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.51 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  39.24 
 
 
223 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 
281 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.24 
 
 
251 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
272 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  33.96 
 
 
290 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  31.23 
 
 
290 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  33.8 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.97 
 
 
274 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  31.5 
 
 
262 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
258 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  28.76 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  27.72 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
252 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.82 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.11 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  30.13 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.21 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  30.21 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  27.64 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  32.27 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  27.94 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  33.49 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  32.86 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  27.03 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.87 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.95 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.88 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  29.96 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.16 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  32 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 
146 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  28.34 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  28.38 
 
 
325 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  26.53 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  24.72 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  42.31 
 
 
385 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  24.8 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  24.39 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  23.35 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  22.75 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  27.6 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  24.61 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  22.75 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  22.42 
 
 
268 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  23.9 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  23.04 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  45.65 
 
 
729 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  27.23 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  25.89 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>