226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0826 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  81.42 
 
 
116 aa  189  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  73.21 
 
 
115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  68.7 
 
 
116 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
114 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  60.87 
 
 
116 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  66.37 
 
 
116 aa  146  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 
118 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  63.39 
 
 
117 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.82 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  61.61 
 
 
128 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  59.82 
 
 
115 aa  135  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  56.88 
 
 
115 aa  134  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  50.43 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 
118 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  60.71 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  57.41 
 
 
128 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  52.34 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  49.53 
 
 
165 aa  124  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
128 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  53.27 
 
 
150 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  51.35 
 
 
126 aa  123  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  48.54 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 
121 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  52.43 
 
 
135 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  48.21 
 
 
120 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  48.21 
 
 
120 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  51.4 
 
 
141 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0410  aspartate alpha-decarboxylase  48.7 
 
 
134 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 
127 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  48.54 
 
 
141 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  50.47 
 
 
135 aa  120  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  49.51 
 
 
135 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  49.51 
 
 
135 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  49.51 
 
 
135 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 
127 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  44.35 
 
 
134 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  49.53 
 
 
142 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  51.4 
 
 
126 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  45.95 
 
 
135 aa  119  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 
141 aa  120  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  48.6 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  52.78 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  52.78 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  50.47 
 
 
120 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
125 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  48.21 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  52.43 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  48.6 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  44.86 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  51.96 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  57.8 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  46.85 
 
 
141 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  53.7 
 
 
127 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
134 aa  116  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
150 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  49.14 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  52.78 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  50.94 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  52.34 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  48.54 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  48.6 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  47.75 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  47.75 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  47.32 
 
 
137 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 
127 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  46.6 
 
 
142 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 
134 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>