227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0774 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 125 aa  256  7e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0410  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  56.78 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.12 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 		 134 aa  127  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  54.24 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  49.59 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  52.76 
 
 		 128 aa  123  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  49.59 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  52.94 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1013  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354884  normal  0.0946421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  48.76 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  52.94 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  54.7 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.46 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2699  aspartate 1-decarboxylase  51.69 
 
 		 127 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  50.43 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  49.15 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  47.62 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  53.85 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  47.5 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1838  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  47.46 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  49.17 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1864  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  45.83 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  45 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3547  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  52.54 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  49.58 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  48.36 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  47.5 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  44.17 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  47.54 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  47.5 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  45 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  48.33 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>