227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0102 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
133 aa  270  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  68.42 
 
 
116 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  63.11 
 
 
135 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  63.64 
 
 
127 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  62.81 
 
 
127 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
126 aa  140  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  55.12 
 
 
127 aa  140  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  57.85 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  57.85 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  58.2 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  59.29 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 
126 aa  137  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 
128 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
126 aa  136  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
127 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  55.93 
 
 
128 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  56.2 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  56.41 
 
 
156 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  54.76 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  53.72 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  53.54 
 
 
129 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  56.2 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  56.2 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 
121 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  55.37 
 
 
126 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  57.26 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  60.91 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  52.8 
 
 
131 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  59.09 
 
 
141 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  58.18 
 
 
150 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  57.85 
 
 
127 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  61.82 
 
 
136 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  56.64 
 
 
135 aa  130  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
142 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  58.18 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  53.72 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
126 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  52.07 
 
 
131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
128 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
149 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  55.96 
 
 
131 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  51.24 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  58.68 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  51.24 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  48.76 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  57.27 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 
128 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
135 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  57.89 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  52.5 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  53.39 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3547  aspartate alpha-decarboxylase  51.22 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  54.1 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  56.64 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 
141 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  58.18 
 
 
137 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0379  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
131 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.172281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2699  aspartate 1-decarboxylase  51.28 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  54.92 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  52.14 
 
 
126 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  50.38 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  55.17 
 
 
133 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 
165 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
115 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
120 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
120 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>