226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9159 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  77.94 
 
 
138 aa  206  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  76.64 
 
 
150 aa  204  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  75.36 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  73.53 
 
 
156 aa  193  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  75.4 
 
 
134 aa  191  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  72.99 
 
 
139 aa  190  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  76.67 
 
 
141 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  71.21 
 
 
135 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  71.21 
 
 
135 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  71.21 
 
 
135 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  77.05 
 
 
145 aa  188  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  71.21 
 
 
139 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  71.97 
 
 
135 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  78.33 
 
 
142 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  74.02 
 
 
141 aa  186  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  72.26 
 
 
149 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  63.45 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  69.84 
 
 
165 aa  177  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  70.63 
 
 
135 aa  176  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  67.72 
 
 
141 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  68.61 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  66.42 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  68.66 
 
 
136 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  70 
 
 
141 aa  169  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  65.85 
 
 
142 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  62.41 
 
 
141 aa  167  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  72.06 
 
 
160 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  69.05 
 
 
138 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  62.31 
 
 
155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  68.7 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  65.87 
 
 
145 aa  159  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  63.41 
 
 
126 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  65.62 
 
 
135 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  73.02 
 
 
144 aa  157  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.85 
 
 
126 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  63.49 
 
 
151 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 
127 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  58.52 
 
 
154 aa  150  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  59.17 
 
 
127 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  62.39 
 
 
127 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  54.76 
 
 
131 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  65.49 
 
 
116 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  59.83 
 
 
127 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  60.98 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  61.21 
 
 
135 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 
135 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  61.26 
 
 
128 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  57.63 
 
 
118 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  62.07 
 
 
131 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 
125 aa  140  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 
118 aa  140  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 
126 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  53.66 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  59.65 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  53.03 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  52.85 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  55.91 
 
 
131 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  55.12 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  55.12 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  51.94 
 
 
128 aa  135  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 
117 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 
116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  52.8 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  51.22 
 
 
127 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 
126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 
126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.03 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  53.85 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
132 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  46.88 
 
 
128 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  53.45 
 
 
116 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  55.17 
 
 
126 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
127 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
128 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  52.46 
 
 
127 aa  130  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
128 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
128 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>