226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3887 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  89.36 
 
 		 141 aa  262  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  75.56 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  69.92 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  73.98 
 
 		 156 aa  184  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  72.95 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  73.33 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  71.09 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  72.13 
 
 		 165 aa  178  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  71.67 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  70.83 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  69.11 
 
 		 139 aa  175  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  68.85 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  65.85 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  68.85 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  71.31 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  65.85 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  67.21 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  67.21 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  67.21 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  68.03 
 
 		 139 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  65.57 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  62.6 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  62.6 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  64.23 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  62.6 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  64.75 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  64.46 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  62.6 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  57.69 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  61.79 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  60.16 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  62.86 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  60.83 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  62.07 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.38 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  55 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  62.07 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  62.61 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  62.61 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  61.74 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  65.04 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  59.83 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  55.91 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  55.37 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  60.18 
 
 		 116 aa  140  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  55.83 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  55.28 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  55.2 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  59.82 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  51.56 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  57.26 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  55.46 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  53.39 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  51.22 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  50.41 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  52.42 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  52.42 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>