227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1862 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  78.95 
 
 		 134 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  77.95 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  69.85 
 
 		 150 aa  193  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  73.28 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  70.68 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  71.88 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  69.92 
 
 		 136 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  66.91 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  65.19 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  68.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  66.92 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  67.21 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  67.72 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  64.71 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  66.67 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  67.5 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  60.29 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  64.52 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  64.23 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  65 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  60.45 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  61.31 
 
 		 138 aa  153  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  61.42 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  63.71 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  60.16 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  67.72 
 
 		 160 aa  150  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  60.83 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  59.23 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  60.68 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  57.89 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  59.83 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  54.03 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  57.48 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  59.02 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  64.6 
 
 		 116 aa  141  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  59.83 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  66.41 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  58.2 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  58.2 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  63.48 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  57.14 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  56.67 
 
 		 126 aa  140  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  60.36 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  54.96 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  53.39 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  55.73 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  54.96 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  56.56 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  58.47 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  58.33 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  55.91 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  52.07 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 		 117 aa  131  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  50.79 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  55.37 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  54.55 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  53.33 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  51.24 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>