227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3464 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  79.13 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  70.43 
 
 		 116 aa  174  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  71.3 
 
 		 116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  69.57 
 
 		 115 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  66.09 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  62.61 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  63.48 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  63.16 
 
 		 114 aa  156  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  63.48 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  63.48 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  62.61 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  61.74 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  63.39 
 
 		 116 aa  149  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  62.28 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  61.4 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  60.87 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  60.87 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  59.65 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  59.46 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  61.06 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  61.26 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  58.88 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  53.91 
 
 		 145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  53.04 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  53.91 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  53.91 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>