226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0461 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  80.62 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  75.36 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  77.44 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  73.33 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  73.85 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  74.81 
 
 		 135 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  75.59 
 
 		 134 aa  190  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  72.87 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  69.77 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  76.86 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  76.86 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  76.86 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  77.31 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  67.16 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  77.59 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  78.81 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  72.09 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  71.76 
 
 		 149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  76.72 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  71.09 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  70.23 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  74.14 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  77.95 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  66.67 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  65.35 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  66.67 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  65.29 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  60.77 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  66.95 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  70.68 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  64.52 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  62.07 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  63.49 
 
 		 151 aa  157  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  63.56 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  63.39 
 
 		 118 aa  151  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  67.62 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  64.52 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  61.02 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  57.81 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  60.17 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  61.34 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  64.55 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  58.68 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 		 127 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  61.82 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  58.62 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  57.38 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  59.09 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  54.47 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  58.04 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  54.92 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  54.92 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  54.1 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  56.78 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  58.04 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  60.36 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  59.46 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  57.27 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  47.62 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  59.63 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  53.15 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  52.68 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  48.03 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  57.27 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 133 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  56.31 
 
 		 116 aa  126  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  51.64 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>