227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0212 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
136 aa  270  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  71.21 
 
 
139 aa  196  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  74.02 
 
 
149 aa  193  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  71.43 
 
 
150 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  68.38 
 
 
156 aa  189  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  69.77 
 
 
135 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  69.17 
 
 
145 aa  184  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  68.38 
 
 
138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  67.67 
 
 
134 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  69.92 
 
 
137 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  66.41 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  67.94 
 
 
135 aa  176  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 
134 aa  176  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  67.97 
 
 
141 aa  176  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  75.59 
 
 
160 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  68.85 
 
 
135 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  68.85 
 
 
135 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  68.85 
 
 
135 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  70 
 
 
141 aa  173  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  70 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  63.97 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  65.85 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  69.17 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  68.66 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  68.85 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  61.19 
 
 
135 aa  166  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  64.57 
 
 
135 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  64.84 
 
 
141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  64.89 
 
 
138 aa  161  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  63.93 
 
 
134 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  63.11 
 
 
134 aa  159  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  65.93 
 
 
144 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.98 
 
 
126 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  62.2 
 
 
141 aa  157  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  59.4 
 
 
132 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 
145 aa  156  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  61.79 
 
 
155 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  57.89 
 
 
154 aa  153  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  60.16 
 
 
135 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  60.32 
 
 
126 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  59.84 
 
 
131 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 
127 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 
127 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  62.16 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  64.91 
 
 
125 aa  144  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  64.86 
 
 
116 aa  144  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  61.16 
 
 
151 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 
126 aa  143  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 
118 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  59.2 
 
 
128 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 
127 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
128 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  63.3 
 
 
131 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 
118 aa  140  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  58.77 
 
 
127 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 
127 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  138  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 
127 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
117 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 
127 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  60.18 
 
 
125 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 
127 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  55.17 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  53.33 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  50.85 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  55.17 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
118 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  61.82 
 
 
133 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  51.15 
 
 
131 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  55.45 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  48.31 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  56.25 
 
 
133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  46.15 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  48.31 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  54.17 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>