227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5363 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
135 aa  268  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  86.67 
 
 
135 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  86.67 
 
 
135 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  86.67 
 
 
135 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  86.67 
 
 
134 aa  234  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  85.19 
 
 
139 aa  234  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  83.21 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  77.6 
 
 
165 aa  198  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  81.67 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  80 
 
 
142 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  76.56 
 
 
141 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  71.32 
 
 
135 aa  190  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  75.41 
 
 
145 aa  190  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  74.81 
 
 
135 aa  190  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  73.28 
 
 
150 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  72.18 
 
 
139 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  75.4 
 
 
149 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  71.97 
 
 
142 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  69.47 
 
 
138 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  71.76 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  65.38 
 
 
155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  72.5 
 
 
150 aa  180  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  73.77 
 
 
141 aa  177  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  74.81 
 
 
144 aa  177  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  67.94 
 
 
136 aa  176  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  71.43 
 
 
141 aa  174  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  67.41 
 
 
134 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  69.67 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  66.92 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  63.7 
 
 
135 aa  170  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  65.12 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  68 
 
 
145 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  65.52 
 
 
135 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  63.93 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  65.04 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  58.54 
 
 
126 aa  159  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 
160 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  67.26 
 
 
116 aa  154  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  60.66 
 
 
126 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  59.32 
 
 
118 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  65.14 
 
 
131 aa  148  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 
134 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  62.93 
 
 
134 aa  146  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  56.1 
 
 
127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  62.83 
 
 
128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  55.28 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  58.97 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  61.95 
 
 
132 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 
127 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  54.7 
 
 
117 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  60.87 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  58.62 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
135 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  59.29 
 
 
131 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  59.29 
 
 
131 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  59.29 
 
 
127 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  50.78 
 
 
133 aa  136  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  54.24 
 
 
128 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 
131 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 
115 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  48.85 
 
 
131 aa  135  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  58.41 
 
 
131 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  60.55 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
126 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  57.52 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 
128 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 
127 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  58.93 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  52.14 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  46.88 
 
 
126 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  46.88 
 
 
126 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  56.64 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  55.56 
 
 
125 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
126 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  49.19 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  50.83 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 
114 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>