226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4555 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  79.13 
 
 		 117 aa  186  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  73.04 
 
 		 116 aa  181  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  71.3 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  68.7 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  67.83 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  66.96 
 
 		 116 aa  160  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  68.81 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  66.37 
 
 		 116 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  66.96 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  62.28 
 
 		 114 aa  151  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  63.39 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  63.39 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  63.64 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  60.36 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  59.46 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  59.82 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  58.93 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  59.46 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  60.55 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  60.36 
 
 		 135 aa  140  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  58.93 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  58.93 
 
 		 135 aa  137  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  56.76 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  61.4 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  55.86 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  60.87 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  57.52 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  57.14 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  54.46 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  51.26 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  50.42 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  56.6 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>