227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1645 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
131 aa  261  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  78.74 
 
 
126 aa  194  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  68.7 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  66.95 
 
 
150 aa  159  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  63.87 
 
 
141 aa  157  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  66.97 
 
 
139 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  68.81 
 
 
134 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  68.81 
 
 
139 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  61.24 
 
 
141 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  64.35 
 
 
138 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  64.35 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 
141 aa  153  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  67.89 
 
 
135 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  62.61 
 
 
150 aa  151  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.86 
 
 
126 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  67.62 
 
 
135 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  63.56 
 
 
156 aa  150  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  58.91 
 
 
149 aa  150  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  66.06 
 
 
135 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  66.06 
 
 
135 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  65.14 
 
 
135 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  66.06 
 
 
135 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  59.23 
 
 
137 aa  147  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  56.92 
 
 
134 aa  147  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  65.14 
 
 
145 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  59.32 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  61.86 
 
 
125 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  63.3 
 
 
136 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  59.63 
 
 
132 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  55.81 
 
 
135 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  56.39 
 
 
141 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  59.63 
 
 
134 aa  140  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  60.83 
 
 
155 aa  140  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  60.55 
 
 
134 aa  139  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  60.55 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  61.47 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  53.12 
 
 
141 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  51.56 
 
 
127 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  51.56 
 
 
127 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  56.88 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  56.9 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  57.39 
 
 
117 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  60.55 
 
 
128 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
116 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  49.61 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  58.47 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  55.96 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  56.67 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  54.72 
 
 
120 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
126 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  55.96 
 
 
131 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  48.82 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  55.96 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  48.03 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.96 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  55.83 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  52.94 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  55.96 
 
 
133 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  127  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  53.33 
 
 
127 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 
127 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  55.24 
 
 
127 aa  127  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  55.56 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  55.05 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  57.28 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 
128 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  54.63 
 
 
121 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  54.13 
 
 
127 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  56.59 
 
 
160 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  55.96 
 
 
127 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  57.8 
 
 
145 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>