226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3536 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  68.42 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  53.39 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  62.73 
 
 		 116 aa  140  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  54.24 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  55.08 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  53.39 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  59.46 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  57.89 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  55.17 
 
 		 118 aa  133  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  56.76 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  57.27 
 
 		 135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  57.66 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  55.26 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0199  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.649486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  61.26 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  54.46 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>