227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2123 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 
121 aa  249  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  68.42 
 
 
118 aa  163  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  55 
 
 
126 aa  140  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  60.18 
 
 
117 aa  136  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  53.78 
 
 
120 aa  136  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  53.39 
 
 
128 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  50.83 
 
 
126 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
126 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
149 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
141 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  57.26 
 
 
131 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  56.41 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  56.41 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  57.02 
 
 
133 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 
127 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 
135 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  54.46 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
128 aa  127  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  51.67 
 
 
126 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
120 aa  127  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
120 aa  127  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
134 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  54.78 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 
150 aa  127  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
165 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
116 aa  126  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 
138 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  51.72 
 
 
141 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  54.46 
 
 
127 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  56.6 
 
 
131 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 
127 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 
129 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
128 aa  123  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
135 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
126 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 
139 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 
135 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 
125 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 
121 aa  123  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
139 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  50.86 
 
 
135 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
141 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>