226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2970 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 120 aa  246  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 120 aa  246  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  94.92 
 
 		 120 aa  233  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  77.31 
 
 		 120 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  73.11 
 
 		 120 aa  181  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  61.67 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  63.79 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  61.74 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  58.47 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  60 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  59.17 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  59.17 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  59.17 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  60.53 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  58.33 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  55.83 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  55 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  55.83 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  58.77 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  55.83 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  53.33 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  53.33 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  52.5 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  60.95 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 126 aa  133  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  48.33 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  57.27 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  53.57 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0410  aspartate alpha-decarboxylase  52.89 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  49.58 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  55.08 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  51.75 
 
 		 156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1578  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  54.78 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  51.28 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  53.51 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  53.98 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0175  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2688  aspartate 1-decarboxylase  53.15 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40119  normal  0.0325759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3089  aspartate 1-decarboxylase  53.15 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  53.04 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>