226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1422 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  69.91 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  66.37 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  68.14 
 
 		 135 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  67.26 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  67.26 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  67.26 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  64.6 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  65.49 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  62.83 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  66.67 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  65.49 
 
 		 142 aa  147  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  63.39 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  64.6 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  64.6 
 
 		 141 aa  146  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  63.06 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  61.06 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  66.67 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  63.06 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  62.16 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  66.37 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  64.86 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  61.95 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  64.6 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  61.06 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  58.41 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  59.29 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  64.6 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  57.52 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  61.95 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  62.73 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  62.73 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  57.27 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  60.18 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  59.63 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  58.41 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  60.36 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  61.61 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  56.03 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  59.82 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  58.93 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  70 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  59.26 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  54.55 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  61.95 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  69.37 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  53.51 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  55.86 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  55.75 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  57.27 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  55.86 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  54.95 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  54.95 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>