227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1979 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  68 
 
 
126 aa  174  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  66.67 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  65.35 
 
 
128 aa  168  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  66.39 
 
 
127 aa  167  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  63.93 
 
 
127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  63.93 
 
 
127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  62.4 
 
 
126 aa  163  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  59.2 
 
 
127 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  62.3 
 
 
127 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  68.1 
 
 
116 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  61.6 
 
 
127 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  63.71 
 
 
127 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  66.1 
 
 
118 aa  158  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  58.87 
 
 
125 aa  157  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  61.48 
 
 
127 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  60.16 
 
 
127 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  66.38 
 
 
118 aa  154  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  63.48 
 
 
116 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  65.22 
 
 
115 aa  153  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  66.09 
 
 
117 aa  152  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  61.74 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  63.16 
 
 
114 aa  150  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  65.49 
 
 
117 aa  151  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  58.97 
 
 
127 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  59.35 
 
 
126 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  59.35 
 
 
126 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  59.35 
 
 
126 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  59.66 
 
 
141 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  66.96 
 
 
116 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  63.16 
 
 
121 aa  146  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  54.84 
 
 
128 aa  144  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  58.62 
 
 
116 aa  144  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  54.76 
 
 
156 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  52.34 
 
 
150 aa  143  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 
135 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  56.8 
 
 
128 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
136 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 
114 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  59.48 
 
 
115 aa  141  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
149 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 
137 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  64.04 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  57.63 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  57.85 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  52.85 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  60.34 
 
 
125 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  53.66 
 
 
139 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  61.61 
 
 
116 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
127 aa  137  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  52.54 
 
 
165 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  51.94 
 
 
142 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  54.24 
 
 
135 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 
134 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  55.08 
 
 
135 aa  135  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  51.69 
 
 
141 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  55.08 
 
 
138 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
141 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  61.21 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
141 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  46.83 
 
 
128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  52.54 
 
 
142 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  53.04 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  55.36 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  52.1 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  52.94 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 
151 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
135 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  54.05 
 
 
135 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
135 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  57.66 
 
 
128 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  52.99 
 
 
135 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  58.56 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  55.65 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  54.39 
 
 
133 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>