227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0118 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  65.87 
 
 
126 aa  177  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  65.87 
 
 
126 aa  173  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  65.87 
 
 
126 aa  173  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1668  aspartate alpha-decarboxylase  64.29 
 
 
126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  64.29 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  60.16 
 
 
128 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  57.94 
 
 
126 aa  150  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  58.87 
 
 
127 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  57.14 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  55.12 
 
 
133 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  58.97 
 
 
121 aa  139  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
115 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
127 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  53.28 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  56.67 
 
 
121 aa  137  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
114 aa  136  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  53.66 
 
 
127 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 
116 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  52.46 
 
 
127 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 
135 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 
118 aa  134  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  55.37 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  54.1 
 
 
127 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  54.1 
 
 
127 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  52.46 
 
 
128 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  55.46 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  56.64 
 
 
114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  53.78 
 
 
141 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  48.36 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  55.45 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
126 aa  129  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  54.17 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2316  aspartate alpha-decarboxylase  50.42 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  56.88 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
124 aa  128  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  54.31 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  51.64 
 
 
128 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
127 aa  127  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  53.91 
 
 
151 aa  126  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  50.42 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  55.96 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
154 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
156 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  54.13 
 
 
131 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  52.63 
 
 
115 aa  124  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 
150 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
120 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 
138 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
141 aa  123  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1959  aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 
132 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.65087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 
126 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 
165 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 
126 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 
138 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  49.12 
 
 
131 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  50.88 
 
 
118 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 
150 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  50.46 
 
 
135 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  50.46 
 
 
135 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  48.7 
 
 
141 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  50.46 
 
 
135 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  48.25 
 
 
131 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  48.25 
 
 
131 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  53.45 
 
 
115 aa  120  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3547  aspartate alpha-decarboxylase  49.59 
 
 
127 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218504  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  51.75 
 
 
134 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
120 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
120 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  50.88 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  48.7 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2699  aspartate 1-decarboxylase  48.76 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  46.61 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  51.38 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  47.83 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1522  aspartate alpha-decarboxylase  45.38 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  50.91 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
116 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>