227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0636 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
155 aa  306  5e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  71.74 
 
 
151 aa  201  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  67.57 
 
 
145 aa  199  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  65.47 
 
 
138 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  65.38 
 
 
135 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  65.38 
 
 
139 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  65.08 
 
 
156 aa  174  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  65.08 
 
 
134 aa  173  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  65.08 
 
 
135 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  65.08 
 
 
135 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  65.08 
 
 
135 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  60.15 
 
 
165 aa  171  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  60 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  61.43 
 
 
145 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  65.29 
 
 
135 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  62.31 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  62.6 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  64.46 
 
 
149 aa  163  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  62.6 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  64.46 
 
 
141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  60.98 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  64.17 
 
 
142 aa  160  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  63.33 
 
 
150 aa  159  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  58.52 
 
 
135 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  61.67 
 
 
141 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  61.79 
 
 
136 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  58.87 
 
 
141 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  65.87 
 
 
144 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  57.25 
 
 
138 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  61.11 
 
 
128 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  57.72 
 
 
134 aa  150  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  60.83 
 
 
137 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  55.28 
 
 
154 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  58.54 
 
 
139 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  54.24 
 
 
126 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  65.22 
 
 
126 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  59.15 
 
 
160 aa  144  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  58.33 
 
 
127 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  61.06 
 
 
116 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  53.85 
 
 
117 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  57.03 
 
 
141 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 
127 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  60.83 
 
 
131 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  57.52 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  56.03 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  54.31 
 
 
134 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  55.17 
 
 
134 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
127 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
127 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  53.98 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  52.17 
 
 
127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  55.45 
 
 
128 aa  130  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  52 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  51.2 
 
 
131 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  51.2 
 
 
131 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  53.1 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  49.19 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  50.41 
 
 
127 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  52.59 
 
 
131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  45.38 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  51.3 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  52.17 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  61.26 
 
 
118 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  51.38 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  47.46 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  52.38 
 
 
118 aa  124  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  47.32 
 
 
115 aa  123  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 
126 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 
126 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  46.15 
 
 
128 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  47.79 
 
 
127 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  52.73 
 
 
126 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  47.22 
 
 
115 aa  121  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>