227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4376 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 160 aa  310  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  88.97 
 
 		 149 aa  244  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  73.33 
 
 		 150 aa  200  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  70.29 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  75.59 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  70.59 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  69.85 
 
 		 138 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  72.06 
 
 		 142 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  73.77 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  66.42 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  70.68 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  73.6 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  70.87 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 		 135 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  77.39 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  75.41 
 
 		 139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  70.08 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  69.67 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  69.17 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  73.91 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  65.67 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  67.72 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  71.68 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  59.57 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  64.29 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  64.57 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  67.19 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  64.8 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  65.04 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  73.23 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  65.04 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  59.26 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  60.34 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  61.95 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  62.61 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  60.33 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  69.37 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  62.5 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  60.87 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  61.74 
 
 		 134 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  56.59 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  62.61 
 
 		 134 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  63.06 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  54.4 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  59.13 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  57.89 
 
 		 118 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  57.39 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  58.26 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  59.29 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  52.89 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  53.91 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  56.52 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  61.06 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  57.76 
 
 		 118 aa  134  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  49.61 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  54.17 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  52.5 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  54.87 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  56.36 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4106  aspartate 1-decarboxylase  55 
 
 		 120 aa  131  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  54.05 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  52.5 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  54.78 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  53.04 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3187  aspartate alpha-decarboxylase  49.15 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  56.14 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  50.37 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  56.52 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  55.26 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  52.5 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0368  aspartate 1-decarboxylase  56.78 
 
 		 124 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.574262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  51.67 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>